Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Oktober 2023 – Januari 2024 di Peraian Dusun Tihi-Tihi Kota Bontang Kalimantan Timur. Pulau Tihi-Tihi merupakan kawasan yang memiliki potensi perikanan. Sumberdaya perikanan di kawasan tersebut juga merupakan aset yang perlu dikembangkan dan dimanfaatkan dengan baik. Waktu tempuh untuk menuju perkampungan tersebut sekitar 40-60 menit dari pelabuhan Tanjung Laut menggunakan perahu klotok. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui pengaruh substrat terhadap morfometrik lamun jenis Thalassia hemprichii di Perairan Dusun Tihi-Tihi Kota Bontang Kalimantan Timur. Hasil penelitian menunjukkan bahwa adanya perbedaan lebar daun, panjang rhizome dan panjang akar dan faktor berpengaruh di setiap stasiun nya. Hasil pengukuran morfometrik lamun Thalassia hemprichii memiliki jumlah daun berkisar 4 – 5 helaian, panjang daun berkisar 1 cm - 10 cm, lebar daun berkisar 0.9 mm – 1.4 cm, panjang rhizome berkisar 2.5 cm - 11.2 cm, diameter rhizome berkisar 2.3 cm - 4.25 cm, jumlah akar berkisar 1 helai – 8 helai, panjang akar berkisar 0.9 mm – 6.4 cm. morfometrik lamun dipengaruhi oleh parameter kimia substrat dan ketersediaan nutrien.