Fitoplankton merupakan organisme pertama yang terpengaruh oleh perubahan di perairan karena sangat sensitif terhadap pencemaran. Pencemaran air dan peningkatan nutrien dari limbah tambak dapat mempengaruhi pertumbuhan fitoplankton, yang berdampak pada kualitas air. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis hubungan fitoplankton, ketersediaan nutrien, dan memprediksi jumlah fitoplankton per kelas terhadap peningkatan nutrien menggunakan pendekatan. Data dikumpulkan pada bulan Januari-Februari Tahun 2023 di Tambak Desa Pegat Batumbuk, Berau. Analisis data dilakukan menggunakan Rstudio versi 2023.2.1 dengan pendekatan Generalized Poisson Regression (GPR). Hasil GPR menunjukkan bahwa fitoplankton memiliki hubungan erat dengan ketersediaan nutrien, khususnya terkait dengan kelimpahan kelas Bacillariophyceae yang mendominasi setiap peningkatan konsentrasi nitrat di perairan. Kenaikan konsentrasi nitrat sebesar 1 mg/L diperkirakan akan meningkatkan kelimpahan Bacillariophyceae sebesar 4,5763 ind/L di tambak terbengkalai, 2,4106 ind/L di tambak tradisional, dan 5,5906 di perairan mangrove.