Praktek Kerja Profesi Apoteker (PKPA) merupakan media yang sangat penting bagi mahasiswa profesi apoteker untuk menerapkan dan mengembangkan ilmu dalam melaksanakan pekerjaan kefarmasian. Oleh karena itu, untuk menghasilkan Apoteker yang kompeten di bidangnya maka Fakultas Farmasi Universitas Mulawarman bekerja sama dengan Apotek, Rumah Sakit, Industri, Puskesmas, dan Pedagang Besar Farmasi (PBF) untuk menyelenggarakan Praktik Kerja Profesi Apoteker (PKPA) yang diharapkan dengan dilakukannya praktik secara langsung ke lapangan dan secara online, calon apoteker dapat melaksanakan fungsi dan tanggung jawab apoteker secara professional baik dalam hal memberikan pelayanan kesehatan pada masyarakat, ataupun dalam hal manajerial, pelayanan kefarmasian, serta penerapan prinsip disribusi obat. Telah dilaksanakan rangkaian proses praktik kerja profesi apoteker (PKPA) oleh mahasiswa Program Studi Pendidikan Profesi Apoteker Universitas Mulawarman di berbagai sarana kesehatan di Kalimantan Timur antara lain PBF PT Duaputra Jaya Mandiri, Rumah Sakit Pertamina Balikpapan, Apotek Kimia Farma 907 Loa Janan dan Puskesmas Air Putih Samarinda serta Industri PT. Indofarma Tbk. dan CV. Berlian Kosmetik terhitung dari tanggal 23 Januari 2023 sampai dengan tanggal 29 September 2023.