Ekosistem padang lamun menjadi tempat berkembang biak, bertahan hidup, mencari makan bagi biota laut diantaranya adalah jenis makrozoobentos. Hubungan antara padang lamun dan makrozoobentos dapat di nyatakan dengan adanya penelitian tentang hubungan timbal balik antara lamun dan makrozoobentos yang ditemukan pada ekosistem padang lamun ini. Untuk mengetahui hubungan padang lamun dan makrozoobentos, peneliti mengambil sampel pada perairan selangan dengan metode transek kuadran 50 x 50 cm. Menghitung jumlah tegakan lamun dan menganalisis jenis lamun pada kotak kuadran disetiap titik stasiun pengulangan serta mengambil sampel sedimen dengan kedalam 5 cm untuk menganalisis jenis makrozoobentos yang tertangkap. Terdapat 3 jenis lamun yaitu thalassia hemprichii, enhalus acoroides, dan halopila minor. 27 spesies makrozoobentos dalam dua kelas yaitu kelas pelecypoda dan gatropoda. Dari hasil analisis sampel dapat dikatakan bahwa hubungan antara lamun dan makrozoobentos pada perairan Selangan kota Bontang sangat lemah dengan kategori keanekaragaman golongan 1 atau sedang.