Penelitian ini dilakukan di Sungai Sebenaq, Kampung Ujoh Bilang, Kecamatan Long Bagun, Kabupaten Mahakam Ulu, Kalimantan Timur. Pengambilan sampel dilakukan pada 5 stasiun, dengan dua periode musim. Kualitas air sungai untuk parameter COD dan Fecal Coli melebihi baku mutu, status mutu air sungai yang ditentukan menggunakan metode STORET menunjukan bahwa pada seluruh stasiun dalam kategori Cemar Sedang, sedangkan dengan metode Indeks Pencemar pada seluruh stasiun dalam kategori Cemar Ringan, serta profil penampang sungai dari bagian hulu sampai hilir menunjukkan berbagai macam variasi.