Kejadian stunting merupakan salah satu masalah gizi pada anak yang memiliki prevalensi tinggi di Indonesia . Cut off Point kejadian stunting tidak boleh lebih dari 20%, sedangkan jumlah kejadian stunting di kabupaten kutai timur sebesar 20,87%. Stunting dapat menghambat proses tumbuh kembang pada balita serta berpengaruh terhadap kualitas sumber daya manusia sebagai generasi penerus bangsa.Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan ASI Eksklusif dan Pengetahuan Gizi Ibu dengan kejadian stunting pada balita usia 6-24 bulan selama masa pandemi covid-19 di wilayah kerja puskesmas muara ancalong kabupaten kutai timur. Metode penelitian ini adalah case control dengan balita stunting 25 orang dan balita sehat 25 orang. Pengumpulan data menggunakan kuesioner dan data sekunder hasil pengukuran antropometri. Analisis data menggunakan uji chi-square.Hasil studi ini didapatkan balita stunting tidak diberikan ASI Eksklusif sebesar 84%, Pola asuh tidak baik 64% dan pengetahuan gizi kurang 76%. Uji bivariat menunjukkan ada hubungan antara ASI eksklusif (pvalue = 0,000, OR = 11,156); pola asuh (p-value = 0,004, OR = 5,630) dan pengetahuan gizi ibu (p-value = 0,002, OR = 6,729). Jika dibandingkan dengan control maka anak yang tidak mendapatkan ASI Eksklusif berisiko 11 kali menderita sunting, anak dengan pola asuh yang kurang baik berisiko 5 kali menderita stunting dan ibu dengan pengetahuan gizi kurang anak akan berisiko 6 kali lebih besar menderita stunting.Disimpulkan ada hubungan antara ASI Ekslusif, pola asuh, dan pengetahuan gizi ibu dengan kejadian stunting pada balita. Oleh karena itu perlu adanya pendampingan ASI Ekslusif kepada ibu serta mengenai MPASI dan pengetahuan gizi untuk mencegah stunting ada balita.