Pendekatan regresi nonparametrik dapat digunakan ketika bentuk kurva regresinya tidak diketahui. Salah satu estimator dalam regresi nonparametrik adalah deret Fourier. Deret Fourier memiliki fleksibilitas yang tinggi, dapat digunakan pada data yang polanya tidak diketahui dan terdapat kecenderungan pola data yang berulang. Kelebihan pada deret Fourier dapat mengatasi data yang memiliki fungsi sinus dan cosinus. Tujuan penelitian ini adalah mendapatkan estimasi model regresi nonparametrik deret Fourier serta mengetahui faktor-faktor yang berpengaruh terhadap stunting di Indonesia Tahun 2022. Hasil penelitian ini mendapatkan model terbaik regresi nonparametrik deret Fourier pada kasus stunting menggunakan osilasi optimal sebanyak tiga osilasi yang diperoleh dari nilai Generalized Cross Validation (GCV) sebesar 12,04 dan nilai koefisien determinasi (R2 ) sebesar 89,75%. Hasil pengujian signifikansi parameter menunjukkan bahwa semua variabel prediktor berpengaruh secara signifikan terhadap kasus stunting. Variabel prediktor tersebut diantaranya imunisasi dasar lengkap, ASI eksklusif, berat badan lahir rendah, akses sanitasi layak, dan penduduk miskin.