Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi jenis kelelawar yang terdapat di Gua Batu Gelap, Desa Sukamaju, Kecamatan Tenggarong Seberang, Kabupaten Kutai Kartanegara, Kalimantan Timur. Pengambilan sampel dilakukan pada 3 titik gua dengan menggunakan sweeping net dengan metode purposive sampling selama 60 hari. Hasil identifikasi menunjukkan adanya dua spesies kelelawar dari dua famili berbeda yaitu Hipposideros cervinus dari famili Hipposideridae dan Megaderma spasma dari famili Megadermatidae. Kelelawar tersebut diidentifikasi melalui pengamatan morfologis dan morfometri, menggunakan karakter kunci dari buku panduan lapangan. Penelitian ini memberikan data dasar untuk pengelolaan kawasan gua secara berkelanjutan serta menjadi referensi bagi penelitian kelelawar selanjutnya.