Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui dan mendeskripsikan bentuk kendala dan perbaikan sistem belajar mengajar pada masa pandemi COVID-19 di SMPN 2 Tanah Grogot Kabupaten Paser, sebelum dan sesudah adanya pandemi COVID-19. Jenis penelitian ini adalah deskriptif kualitatif. Pengumpulan data dilakukan dengan penelitian observasi, wawancara, dokumentasi dan kepustakaan. Analisis data dilakukan dengan cara pengumpulan data, kondensasi data, penyajian data dan penarikan kesimpulan. Hasil penelitian menunjukan di masa pandemi COVID-19 pembelajaran di lakukan sesuai perintah Mentri Pendidikan melalui Surat Nomor 36962 tentang Pembelajaran secara Daring dan bekerja dari rumah pencegahan penyebaran Corona Virus Disease (COVID- 19). Sistem belajar mengajar melalui media daring di SMPN 2 Tanah Grogot di masa pandemi COVID-19 mampu beradaptasi dengan baik, Metode pembelajaran tidak terdapat perubahan pada sebelum dan saat pandemi COVID-19 hanya media yang digunakan menyesuaikan dengan kondisi di masa pandemi COVID-19. Faktor penghambat gangguan jaringan di beberapa wilayah, meningkatkan ketertarikan sekaligus kualitas pembelajaran siswa. Faktor pendukung hasil sistem belajar mengajar melalui daring waktu dalam pembelajaran di dapat di lakukan kapan saja. Terdapat banyak pihak yang menjalankan fungsi pengawasan Kepala Dinas Pendidikan dan Kebudayaan, Kepala Sekolah, Guru, Orang tua dan murid harus berkerjasama. Perbaikan Sistem Belajar Dan Mengajar di masa COVID-19 terus dilakukan pembenahan dan mengupayakan metode pembelajaran yang telah dilakukan dapat berjalan dengan baik.