Penelitian ini bertujuan: (1) menghasilkan penuntun praktikum Protista berbasis aplikasi android yang layak, efektif dan praktis (2) mengetahui kelayakan penuntun praktikum mata kuliah Protista berbasis aplikasi android yang dikembangkan, (2) mengetahui keefektifan penerapan penuntun praktikum mata kuliah Protista berbasis aplikasi android yang dikembangkan terhadap kinerja dan hasil belajar mahasiswa dalam melaksanakan praktikum dan (3) mengetahui kepraktisan penuntun praktikum mata kuliah Protista berbasis aplikasi android dalam penggunaannya pada pelaksanaan praktikum. Penelitian pengembangan ini berpedoman pada langkah-langkah pengembangan oleh Borg and Gall yang terdiri dari: (1) potensi dan kebutuhan, (2) pengumpulan data, (3) desain produk, (4) validasi produk, (5) revisi produk, (6) uji coba produk dan (7) revisi produk. Subjek uji coba produk terbatas adalah 36 praktikan/mahasiswa semester 5 dengan jumlah subjek uji coba produk pada kelas ekperimen sebanyak 19 praktikan/mahasiswa dan subjek uji coba produk pada kelas kontrol sebanyak 17 praktikan/mahasiswa. Pengumpulan data menggunakan kuisioner, angket, lembar observasi kinerja, afektif, psikomotor dan soal tes kognitif. Teknik analisis data menggunakan uji T Independen (uji Independent Sample T-Test) dengan taraf signifikansi 0,05. Hasil penelitan menunjukkan bahwa penuntun pratikum Protista berbasis aplikasi android yang dikembangkan mendapatkan hasil uji kelayakan ditinjau dari aspek materi dan aspek media dengan kategori “sangat baik” berdasarkan validasi ahli materi, ahli media dan reviewer 10 mahasiswa di atas semester 5. Berdasarkan hasil analisis yang telah dilakukan, penuntun pratikum Protista berbasis aplikasi android efektif untuk meningkatkan kinerja dengan nilai signifikansi 0,022 < 0,05 dan juga efektif untuk meningkatkan hasil belajar dengan nilai signifikansi 0,000 < 0,05. Penuntun pratikum Protista berbasis aplikasi android juga dinilai praktis dalam penggunaannya dengan mendapatkan nilai 69,39 kategori “sangat baik”.