Motivasi belajar yang baik menjadi salah satu faktor tercapainya tujuan pembelajaran, maka diperlukan suatu aplikasi yang dapat membantu dalam meningkatkan motivasi belajar siswa. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui keefektifan aplikasi Chemdraw dalam meningkatkan motivasi belajar siswa kelas XI MIA di SMA Negeri 2 Tenggarong pada materi hidrokarbon. Subjek dalam penelitian ini adalah 72 siswa yang terdiri atas siswa kelas XI MIA 5 dan XI MIA 6 yang dipilih menggunakan teknik purposive sampling. Penelitian ini tergolong penelitian kuantitatif dengan desain penelitian pre-experimental design tipe one group pretest-posttest design. Instrumen dalam penelitian ini yaitu lembar angket yang dibuat berdasarkan indikator motivasi belajar. Hasil penelitian menunjukkan bahwa rerata peningkatan motivasi belajar siswa kelas XI MIA di SMA Negeri 2 Tenggarong tergolong kategori sedang dengan n-gain sebesar 0,46; rerata effect size sebesar 2,03 tergolong kategori sangat kuat; hasil uji statistik (α = 5%) yang menunjukkan ada peningkatan motivasi belajar yang siginifikan setelah digunakan aplikasi Chemdraw. Berdasarkan hal tersebut dapat disimpulkan bahwa penggunaan aplikasi Chemdraw efektif untuk meningkatkan motivasi belajar siswa pada materi hidrokarbon