Bontang merupakan salah satu kota di Kalimantan Timur. Dengan Luas mencapai 497,57 km², dimana sebagian besar merupakan wilayah perairan. sementara luas wilayah daratan hanya sekitar 29%. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keanekaragaman dan kelimpahan plankton sebagai bioindikator kualitas lingkungan perairan Kota Bontang, Kalimantan Timur. Penelitian ini dilakukan pada 4 stasiun yang tersebar di perairan Kota Bontang. Pada masing masing stasiun terdiri dari dua titik yaitu titik 1 pada permukaan perairan dengan kedalaman 0-0,5 cm dan titik 2 pada kedalaman dimana batas cahaya matahari dapat masuk kolom air (batas tingkat kecerahan). Hasil penelitian diperoleh jenis plankton yang ditemukan terdiri dari 7 kelas plankton 5 kelas Bacillariophyceae (11 genus), Dynophyceae (1 genus), Dinophyceae (3 genus), Cynophyceae (1 genus), Crustacea (6 genus) dan Gastropoda (1 genus). Kelimpahan Plankton yang ditemukan berkisar antara 5376-56832 sel/L dengan rata-rata ± kelimpahan adalah 40560-11232 sel/L. Keanekaragaman plankton diperairan sekitar Selangan termasuk dalam katagori rendah hingga sedang. Kelimpahan Plankton di permukaan 0,5 m lebih tinggi dibandingkan dengan kelimpahan di kedalaman 5 m.