Hutan Lindung memiliki peranan yang sangat penting bagi makhluk hidup salah satunya sebagai tempat bagi berbagai macam keanekaragaman jenis tumbuhan yang ada didalam kawasan hutan lindung. Penelitian ini dilakukan di Hutan Lindung Sungai Wain (HLSW) yang berada pada wilayah Kota Balikpapan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui keanekaragaman jenis tumbuhan semai dan pancang di HLSW. Metode yang digunakan pada saat pengambilan data di lapangan dengan menggunakan metode plot berjenjang sepanjang 200 m yang didalamnya terdapat subplot sebanyak 40 dengan ukuran 5 m × 5 m untuk mengidentifikasi tumbuhan pancang dan subplot 2 m × 2 m untuk mengidentifikasi tumbuhan semai. Berdasarkan hasil analisis data yang dilakukan keanekaragaman jenis tumbuhan tingkat semai masih tergolong cukup tinggi dengan nilai sebesar 3,626 dan untuk tingkat pancang tergolong sedang karena memiliki nilai sebesar 2,766. Menurut hasil perhitungan indeks kekayaan jenis pada tumbuhan semai sebesar 3,333 sehingga masuk dalam kategori rendah dan untuk tumbuhan tingkat pancang sebesar 3,922 sehingga masuk dalam kategori sedang. Perhitungan indeks kemerataan jenis untuk tumbuhan tingkat semai sebesar 0,909 dan untuk tingkat pancang sebesar 0,923 dimana keduanya termasuk kategori tinggi.