Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Mei 2021 – Januari 2022. Tujuan penelitian ini untuk mengetahui keanekaragaman, keseragaman serta dominansi jenis plankton yang terdapat muara Sungai Tanjung Limau Kota Bontang Kalimantan Timur dengan kedalaman 0 meter dan 1 meter. Pengambilan sampel air dilakukan pada 4 stasiun yang kemudian di identifikasi di Laboratorium Kualitas Air FPIK UNMUL. Hasil yang diperoleh, ditemukan distribusi plankton yang terdiri dari 14 spesies dari 10 kelas. 10 kelas yang dimaksud adalah Bacillariophyceae, Chlorophyceae, Cyanophyceae, Ochrophyta, Tubulina, Arthropoda, Chrysophyta, Maxillopoda, Oligotricheae dan Polythalamea. Fitoplankton yang ditemukan terdiri dari 5 kelas yaitu Bacillariophyceae, Chlorophyceae, Cyanophyceae, Ochrophyta dan Tubulina dan di peroleh sebanyak 9 spesies. Sedangkan untuk Zooplankton terdapat sebanyak lima kelas yaitu Arthropoda, Chrysophyta, Maxillopoda, Oligotricheae dan Polythalamea dan diperoleh sebanyak 5 spesies. Karakteristik kelimpahan berkisar 1470 sel/L – 6973 sel/L, indeks keanekaragaman dalam kriteria sedang , indeks keseragaman dalam kriteria stabil, dan indeks dominansi dalam kriteria tidak ada jumlah individu dari suatu spesies yang berlimpah.