Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis pengaruh struktur organisasi dan kesiapan untuk berubah terhadap employee engagement dan good governance pada Dinas Koperasi, UKM dan Perindustrian Kota Samarinda. Sampel berjumlah 71 orang pegawai tetap Dinas Koperasi, UKM dan Perindustrian Kota Samarinda yang terlibat sebagai responden dan diberikan kuesioner berisi pertanyaan yang harus dijawab dengan memberikan skor. Metode analisis data yang digunakan adalah dengan menggunakan analasis Structural Equation Model (SEM) menggunakan aplikasi SmartPLS. Hasil penelitian menunjukan bahwa terdapat pengaruh signifikan antara masing-masing struktur organisasi terhadap employee engagement, kesiapan untuk berubah terhadap employee engangement, struktur organisasi terhadap good governance, serta employee engagement terhadap good governance. Namun didapatkan hasil bahwa kesiapan untuk berubah terhadap good governance tidak berpengaruh secara signifikan. Berdasarkan hasil penelitian, hampir seluruh variabel berpengaruh signifikan namun hanya struktur organisasi terhadap good governance yang tidak berpengaruh signifikan, maka jika ada perubahan dalam organisasi, pegawai Dinas Koperasi, UKM dan Perindustrian Kota Samarinda banyak yang tidak mampu maupun enggan untuk melaksanakan perubahan.