Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh suplemen bahan ajar berbasis literasi islam menggunakan model pembelajaran e-learning tipe web course terhadap hasil belajar siswa pada materi ikatan kimia kelas X di MAN 1 Samarinda. Penelitian ini merupakan penelitian kuantitatif dengan metode rancangan quasi experiment jenis non-equivalent control group design. Populasi yang digunakan dalam penelitian ini yaitu seluruh kelas X IPA. Teknik pengambilan sampel yang digunakan adalah purposive sampling, sehingga diperoleh sampel penelitian yaitu kelas kelas X IPA 3 menggunakan suplemen bahan ajar berbasis literasi Islam dan kelas X IPA 2 menggunakan suplemen bahan ajar non-berbasis literasi Islam.Teknik pengumpulan data dilakukan melalui teknik tes dan teknik non tes. Teknik tes terdiri dari post test dan ulangan harian dan teknik non tes terdiri dari angket dan lembar observasi. Data hasil post test, ulangan harian dan angket siswa dianalisis menggunakan uji t. Berdasarkan hasil analisis menggunakan uji t, diperoleh uji thit afektif = 2,27, thit kognitif = 4,86 dan ttab = 1,99 dengan taraf signifikan 5%. Berdasarkan hasil analisis thit afektif dan thit kognitif menunjukkan thit > ttab maka Ha diterima, artinya terdapat pengaruh suplemen bahan ajar berbasis literasi islam menggunakan model pembelajaran e-learning tipe web course terhadap hasil belajar siswa pada materi ikatan kimia kelas X di MAN 1 Samarinda.