Perairan Teluk Balikpapan termasuk teluk semi tertutup di mana keadaan temperatur dan salinitas di sepanjang teluk mengalami perubahan. Tujuan dari penelitian ini adalah
untuk mengetahui pola sebaran temperatur, salinitas dan keadaan massa air di daerah mixed layer ditinjau dari parameter oseanografi. Pengambilan data di lapangan
dilakukan sebanyak 26 stasiun dari depan teluk sampai ujung, dengan menggunakan alat Condctivity Temperature Depth (CTD). Didapatkan Kisaran nilai salinitas di depan teluk berkisar 33.569 psu dan semakin kecil hingga 27.069 psu, di ujung teluk nilai salinitas kembali naik berkisar 31.507 psu. Untuk nilai temperatur di depan teluk berkisar 29.422 ° C dan semakin masuk ke dalam teluk nilai temperatur semakin besar hingga 31. 286 ° C. Dengan demikian dapat disimpulkan bahwa temperatur di daerah yang dangkal lebih besar dan terjadi sedikit perubahan dari permukaan hingga kedalaman maksimal. Sedangkan untuk nilai salinitas sendiri jika dilihat dari pola sebarannya semakin masuk ke dalam teluk nilai salinitas semakin kecil karena dipengaruhi oleh adanya inputan debit air tawar dari anak sungai yang berada di daerah Teluk Balikpapan hal ini pula yang mempengaruhi kondisi massa air di daerah Teluk Balikpapan yang semakin masuk ke dalam teluk semakin kecil.