Regresi nonparametrik merupakan pendekatan untuk pola data yang tidak diketahui bentuk kurva regresinya atau tidak terdapat informasi distribusi mengenai bentuk pola data. Salah satu metode regresi nonparametrik yang dapat digunakan adalah spline. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah regresi nonparametrik spline truncated dalam geographically weighted regression (GWR) dengan pembobot fungsi kernel bisquare. Data yang digunakan dalam penelitian ini adalah data pencemaran air pada DAS Mahakam dengan pH sebagai variabel prediktor. Pada analisis kualitas air di tahun 2018, diambil sampel sebanyak 28 titik lokasi pengamatan yang tersebar disepanjang DAS Mahakam. Rata-rata nilai pH pada DAS Mahakam adalah 7,0661 yang artinya pH pada DAS Mahakam masih dalam kategori netral. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui faktor-faktor yang mempengaruhi tingkat pH pada 28 titik lokasi DAS Mahakam. Hasil yang didapatkan untuk model terbaik adalah model spline truncated dalam GWR dengan dua titik knot dan orde dua. Nilai R-Square yang didapatkan adalah sebesar 99,947 persen dan nilai RMSE sebesar 0,00134. Hasil evaluasi diperoleh faktor-faktor yang mempengaruhi tingkat pH pada DAS Mahakam adalah suhu, daya hantar listrik, TSS, DO, konsentrasi NH3N, dan konsentrasi H2S.