Penelitian ini berfokus pada kinerja instansi pemerintah yang baik maka diperlukan transparansi, akuntabilitas, dan pengendalian intern yang baik pula agar kinerja instansi pemerintah memiliki kualitas yang baik dan memuaskan. Dalam upaya untuk memantapkan mekanisme transparansi dilakukan untuk mengoptimalkan pemberian pelayanan publik. Untuk akuntabilitas, diperlukan sistem pemerintahan yang bersih dan baik. Untuk pengendalian intern, semakin baik pengendalian maka akan semakin baik pula pelaksanaan kinerja instansi pemerintah. Penelitian ini bertujuan untuk menguji pengaruh transparansi, akuntabilitas dan pengendalian intern terhadap kinerja instansi pemerintah pada Dinas Perdagangan Kota Samarinda. Jenis data yang digunakan pada penelitian ini adalah kuantitatif dan pengumpulan data digunakan kuesioner. Dalam penelitian ini diambil sampel dari 52 responden dari Dinas Peradgangan Kota Samarinda. Metode analisis data yang digunakan yaitu uji statistik deskriptif, regresi linier berganda, dengan pengujian uji validitas data, uji reliabilitas data, uji asumsi klasik, uji kelayakan model F, koefisien determinasi dan uji hipotesis Data diolah dengan menggunakan perangkat Software Statical Product And Services Solution (SPSS) versi 21. Hasil penelitian menunjukkan bahwa transparansi berpengaruh terhadap kinerja pemerintah instansi pemerintah pada Dinas Perdagangan Kota Samarinda. Sementara, akuntabilitas dan pengendalian intern tidak berpengaruh terhadap kinerja instansi pemerintah pada Dinas Perdagangan Kota Samarinda.
Kata Kunci : Transparansi, Akuntabilitas, Pengendalian Intern dan Kinerja Instansi Pemerintah