Analisis Quantitative Structure Activity Relationship (QSAR) untuk menentukan pusat aktif enam jenis molekul senyawa isoflavon sebagai obat antivirus SARSCoV-2 dengan menggunakan metode berbasis Ab-Initio telah dilakukan. Tiga tahapan dalam penelitian ini adalah (1) penghitungan struktur elektron dan nilai r untuk mendapatkan struktur optimum, nilai momen dipol dan muatan bersih senyawa isoflavon. Kedua, analisis data dengan membuat model kuantum farmakologis dari kombinasi variabel atom pada 6 senyawa tersebut. Ketiga, analisis regresi multilinear dengan menggunakan multiple liniear regression seperti koefisien korelasi (r) dan standar estimasi (SE). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa metode Ab-Initio berhasil membuktikan wilayah pusat aktif senyawa isoflavon dengan r = 0.98, dan nilai SE = 0.049 dan 0,069 menunjukkan hubungan kuantitatif yang signifikan dengan antivirus dengan model persamaan terbaik sebagai berikut: ln A = -1,97 C11 + 1,96 C12 + 0,14 C14 – 0,82 C15 + , dimana nilai A adalah nilai reaktivitas obat sedangkan C11, C12 + 0,220,25 C14 dan C15 adalah parameter P(i) statistik regresi multilinear dan kerapatan elektron atom ke-i dari senyawa obat.
Kata kunci: Isoflavon, Antivirus SARS-CoV-2, QSAR, Regresi, Ab-initio.