Tanaman Kokang (Lepishantes amoena (Haask) Leenh) merupakan tanaman khas Kalimantan Timur yang mulai langka keberadaannya, apabila tanaman kokang dieksploitasi secara besar-besaran untuk dijadikan sebagai simplisia untuk diekstraksi maka akan menyebabkan kepunahan, sehingga diperlukan isolasi jamur endofit dari daun kokang untuk mencegah kepunahan tersebut. Jamur endofit dapat memproduksi metabolit sekunder yang serupa dengan tanaman inangnya dan umumnya memiliki aktivitas biologis. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengetahui kerakteristik jamur endofit dari daun kokang, mengetahui golongan metabolit sekunder jamur endofit dan mengetahui aktivitas antimikroba terhadap pertumbuhan Propionibacterium acne, Eschericia coli dan Candida albicans. Metode untuk identifikasi golongan metabolit sekunder dilakukan dengan analisis Kromatografi Lapis Tipis (KLT) dan pengujian aktivitas antimikroba dilakukan dengan menggunakan metode KLT-Bioautografi.
Hasil penelitian ini yaitu diperoleh 5 isolat jamur endofit yang memproduksi metabolit sekunder flavonoid, steroid dan tanin yang beraktivitas sebagai antimikroba.
Kata Kunci: KLT-Bioautografi, metabolit sekunder, Propionibacterium acne, Eschericia coli.